Ozon in njegovi sekundarni proizvodi (na primer hidroksil) imajo najmočnejši baktericidni in virucidni učinek, lahko so koristni za preprečevanje širjenja nalezljivih bolezni,
Poskusi kažejo, da enake koncentracije ozona ubijajo bakterije in viruse 600-3000-krat več kot klora.
Ko je koncentracija ozona 1 mg / L, inaktivacija fekalnih kolij traja le 5 sekund, pri enakih koncentracijah klora pa za dosego enakega učinka potrebujete 15.000 sekund.
Ozon je mednarodno priznan okolju prijazen zeleni fungicid ne bo povzročil sekundarnega onesnaževanja okolja, klor reagira z organsko snovjo v vodi, da tvori različne klorirane organske spojine, kot sta kloroform in triklorometan, te snovi so prepoznane mutagene, ki povzročajo raka. Ko ljudje plavajo, te strupene snovi absorbira telo (telo v vodi lahko absorbira 500 ml vode na uro).
Klorirane organske spojine v vodi bodo spodbudile tudi oči in kožo, kar bo povzročilo rdeče oči in kožne izpuščaje.
